Општинската администрација на Општината Арачиново се организира во следните Сектори и (Одделенија)
1.СЕКТОР ЗА ПОДДРШКА НА ГРАДОНАЧАЛНИКОТ, ПРАВНИ, ОПШТИ РАБОТИ И ЧОВЕЧКИТЕ РЕСУРСИ, ЈАВНИ ДЕЈНОСТИ, БУЏЕТ, ФИНАНСИРАЊЕ И ДАНОЧНА АДМИНИСТРАЦИЈА, ИНСПЕКЦИСКИ НАДЗОР И ВНАТРЕШНА РЕВИЗИЈА, во чиј состав се:
1.1. Одделение за поддршка на градоначаникот
1.2. Одделение за правни, општи работи и човечки ресурси
1.3. Одделение за јавни дејности
1.4. Одделение за буџет, финансирање и даночна администрација
1.5. Одделение за инспекциски надзор – инспекторат
1.6. Одделение за внатрешна ревизија
2. СЕКТОР ЗА УРБАНИЗАМ, КОМУНАЛНИ ДЕЈНОСТИ, ЗАШТИТА НА ЖИВОТНА СРЕДИНА И ЛОКАЛЕН ЕКОНОМСКИ РАЗВОЈ
2.1 Одделение за урбанизам и комунални дејности и заштита на животна средина
2.2 Одделение за локален економски развој.